媽祖

護聖宮的主神是媽祖，融合海峽兩岸五方聖母，即所謂五靈合體：
1.莆田祖祠地、2.血脈出生地、3.得道升天地、4.官府首香地、 5.渡台開基地
五地求取信物，焚化後置於琉璃媽祖裡面，集靈合體演化而成。

媽祖正前方有一香爐，依據郭建松副理解說，原先構想媽祖廟內不設香爐，但到媽祖廟進香的善男信女越來越多，大家來到媽祖前面膜拜卻無法上香， 與大家習慣不相同，因此建議設立香爐，以解祭拜時心靈的寄託。

千里眼、順風耳

千里眼與順風耳本是柳精、桃精所化，傳說他們是商代時期紂王的大將
大哥高明 、小弟高覺 ， 有一次與周文王的軍師姜子牙交戰而身亡死後陰魂不散兩位皆四肢裸露。
千里眼將軍，青面獠牙，眼觀千里，右手持叉， 左手舉及額前做遠視狀。
​順風耳將軍，紅面獠牙，耳聽八方，右手持一方天畫戟，側耳作聽音狀。兩位軍長祀於媽祖身前幫媽祖觀聽世間疾苦， 一同輔佐聖母驅邪鎮惡，護佑萬民。

千里眼與順風耳兩尊是由青斗石雕刻，並用玻璃珠、鏡片裝飾而成，面目青獠，使人生畏。

門神

媽祖是道教主神之一，門神是秦瓊與尉遲恭
秦瓊黃臉，手拿雙銅(金間)
尉遲恭黑臉，手拿九節鋼鞭​

祭品

一般祭品分可食用和不可食用，護聖宮採用不可食用的祭品
以捏麵和玻璃製品，捏麵做成各種動物形狀。
​玻璃製品作成玻璃金紙、玻璃水果、玻璃花卉、玻璃動物。

晨鐘暮鼓

「晨鐘暮鼓」這句話﹐很多人會解釋為:
早上敲鐘﹐晚上敲鼓。其實﹐這是錯誤的觀念。
在佛門﹐正確的說法應該是:早上先敲鐘﹐後擊鼓﹔
晚上則先擊鼓﹐再敲鐘。
​
在寺院中﹐安置鼓的建築物﹐稱為鼓樓。
​一般寺院中鼓與鐘常相對安置於大殿前之左右兩方。

天池

 天池是經高人指點，原是天井或內埕，因周圍玻璃擋住氣流，造成內部乾燥，因此作成蓄水池，可調解內部溫溼度
也意外造就一景， 就是晚上時水中倒影成為「水晶宮」非常的美麗。

天池中央有「夔龍」，象徵太極生兩儀
（鯉魚躍龍門）＞兩儀生四象（螭龍：幼龍）＞四象生八卦
​四個角有4隻蝙蝠稱為「天官賜福」。

吉祥龍

吉祥龍為2012年台灣燈會的龍生九子之一
因為龍身是由橘子所組成，取其諧音「吉」
​吉祥龍盤踞護聖宮的廟內。

台灣豐韻圖

由將林基金會委託六方基品牌顧問有限公司設計
規劃本圖的全景配置，聘請水墨畫家王世瑜執行繪製
目標為超越清明上河圖為台灣之最， 本圖為歷時二年半時間製作，為一幅台灣史上最美的最細緻的工筆水墨畫。
讓人一覽無遺的台灣四區域12個景點為創作主題
​全長1170公分寬60公分， 讓人感受台灣藝術的工藝撼動力。

八卦天燈

八卦天燈由24組斗拱所組成，由鹿港鴻華神轎雕刻大師陳秋霖的設計
呈現出傳統藝術與現代科技完美的結合。
​跨距比鹿港龍山寺八卦藻井（16組）還大，堪稱是全國跨距最大的八卦藻井。

燕尾

傳統寺廟建築特色，屋脊兩端成曲線向上揚起，尾端並分叉如燕子的尾巴，因而稱之為「燕尾」
 線條十分優雅。
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護聖宮的燕尾由玻璃藝術家黃琇圓老師所設計的燕尾飛入雲端。

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琉璃香爐

總重達720公斤(1200台斤)，由228片頂級超白玻璃加工堆砌，由於其規格長101公分，寬157公分，高139公分，依廠方楊明和老板表示:該香爐他個人構思設計了21天才定稿，必須講究其安全性、穩定性、耐熱係數，而後再由他們公司同仁五位聯手，花費95個工作天，期間不含短期支援的人手，才順利完成。
其中遇到製作技術盲點，還承蒙台灣遊艇玻璃最大生產廠的高雄陳氏玻璃大力協助，動用全自動雷射切割、噴墨、克服瓶頸。而陳老板本身亦是虔誠媽祖信徒，故所有支援、協助、原材料分文不取，包括近十年來對有關玻璃廟的各項修繕、裝潢。